Выявление РНК коронавируса SARS-CoV-2 в мазке со слизистой носоглотки и/или ротоглотки

Определение РНК коронавируса SARS-CoV-2 – возбудителя тяжелого острого респираторного синдрома (COVID-19) в мазке со слизистой носоглотки и/или ротоглотки методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с детекцией в режиме реального времени.

SARS-CoV-2 (Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus 2) ранее 2019-nCoV (2019 novel coronavirus, Wuhan seafood market pneumonia virus) - одноцепочечный РНК-содержащий вирус.

SARS-CoV-2 относится к большому семейству вирусов – коронавирусов (лат. Coronaviridae), вызывающих респираторные заболевания. В настоящее время известно о циркуляции среди населения четырех видов коронавирусов (HCoV-229E, -OC43, -NL63 и -HKU1), которые круглогодично присутствуют в структуре ОРВИ, и, как правило, вызывают поражение верхних дыхательных путей легкой и средней тяжести. К семейству коронавирусов также относятся опасные вирусы SARS-CoV и MERS-CoV, вызывающие тяжелый острый респираторный синдром и ближневосточный респираторный синдром, соответственно. 

Коронавирус SARS-CoV-2 впервые был обнаружен в конце 2019 году в биологических образцах пациента с атипичной пневмонией во время вспышки пневмонии в городе Ухань (Китай). Вызывает инфекционное заболевание - COVID-19. По предварительным данным первичным источником вируса были животные (генетически близки к SARS-CoV-2 штаммы коронавирусов циркулируют среди подковоносых летучих мышей). В качестве промежуточных хозяев, вероятно, могут выступать другие животные (панголины). На сегодня, основным источником вируса являются инфицированные люди, в том числе находящиеся в инкубационном периоде заболевания.

В настоящее время считается, что инфекция передается воздушно-капельным (при кашле, чихании, разговоре), воздушно-пылевом и контактным путями. При этом факторами передачи могут быть: воздух, пищевые продукты и предметы обихода, контаминированные SARS-CoV-2.

COVID-19 (COronaVIrus Disease 2019) ранее 2019-nCoV - потенциально тяжелая острая респираторная инфекция, вызываемая коронавируса SARS-CoV-2. Представляет собой опасное заболевание, которое может протекать как в форме острой респираторной вирусной инфекции легкого течения, так и в тяжелой форме, специфические осложнения которой связаны с высоким риском смерти.

С января 2020 года Всемирная организация здравоохранения объявила вспышку инфекции, связанной с SARS-CoV-2, чрезвычайной ситуацией в области здравоохранения международного значения, а 11 марта 2020 охарактеризовала мировой масштаб распространения болезни, как пандемию.

Инкубационный период составляет от 2 до 14 суток. 

Диагноз коронавирусной инфекции SARS-CoV-2 устанавливается на основании клинического обследования, данных эпидемиологического анамнеза и результатов лабораторных исследований.

Для заболевания характерно наличие клинических проявлений острой респираторной вирусной инфекции. Основными симптомами являются повышение температуры, кашель сухой или с небольшим количеством мокроты, одышка, миалгия и утомление, ощущение заложенности в грудной клетке. На раннем этапе заболевания возможны диарея, тошнота, рвота. Различают легкую, среднюю и тяжелую формы инфекции SARS-CoV-2. Тяжелая форма заболевания протекает как пневмония с острой дыхательной недостаточностью, острый респираторный дистресс-синдром (ОРДС), сепсис.

Патогенез новой коронавирусной инфекции SARS-CoV-2 изучен недостаточно. Данные о длительности и напряженности иммунитета в настоящее время отсутствуют. Иммунитет при инфекциях, вызванных другими представителями семейства коронавирусов, нестойкий и возможно повторное заражение.

Лабораторная диагностика COVID-19

I. Выявление возбудителя COVID-19 – коронавирус SARS-CoV-2. Позволяют выявить возбудителя, или определить его отдельные элементы (белки, нуклеиновые кислоты).

• Вирусологические методы - позволяют выделить «чистую» культуру вируса. Метод считается референсным для диагностики вирусных инфекций. Практическое использование ограничено требованиями к лаборатории, процедурами предварительной обработки и подготовки образцов, стоимостью и продолжительностью исследования. Метод используется, прежде всего, с исследовательской и научной целью.
• Определение антигенных белков вируса (спектрометрические, иммунологические методы и т.д.) - позволяют определить специфические протеины (белки) вируса. На сегодня методы проходят фазу исследования и разработки технологий, которые будет возможно использовать в практической медицинской деятельности.
• Определение РНК вируса (метод ПЦР) - наиболее чувствительный, специфический, быстрый и доступный метод прямого обнаружения вируса в образцах биологического и не биологического происхождения. Позволяет использовать объективные методы контроля качества, гарантирует высокий уровень достоверности полученных результатов. На сегодня, является методом выбора для диагностики COVID-19.

Для исследования используются биологические образцы, потенциально содержащие возбудителя или его РНК.

II. Выявление антител к возбудителю COVID-19

Серологические исследования для определения антител разных классов (IgM, IgG, IgA) к коронавирусу SARS-CoV-2. Для исследования используются образцы крови (сыворотка).

• Иммунохроматографический анализ («экспресс-тесты») - определение специфических антител IgM, IgG, IgA (дифференцированно, или суммарно) к антигенам коронавируса SARS-CoV-2. Результаты требуют подтверждения более надежными методиками.
• Иммуно-ферментный анализ (ИФА) в различных модификациях - определение специфических IgM, IgG, IgА (дифференцированно, или суммарно) к антигенам коронавируса SARS-CoV-2. Наиболее специфичный серологический метод. Диагностическая точность тестирования зависит от используемой технологии и тест-системы. 

Основным методом этиологической диагностики COVID-19 является метод ПЦР (определение РНК коронавируса SARS-CoV-2)

При оформлении заявок для проведения исследований в ООО «ИНВИТРО» заполняется анкета с обязательным внесением персональных данных человека, который проходит тестирование: 

1. Фамилия Имя Отчество, возраст; 
2. Контактный номер телефона (при наличии регистрации в приложении «Дій вдома» необходимо указывать идентичный номер телефона); 
3. Данные о месте работы или учёбы; 
4. Адрес фактического проживания; 
5. Причины на основании которых принято решение о тестировании;
6. Данные врача, лечебного учреждения, направившего на тестирование. 

Анонимно данный тест не оформляется.

В соответствии со Стандартами оказания медицинской помощи «Коронавирусная болезнь (COVID-19)», утвержденных приказом Министерства здравоохранения (МЗ) Украины от 28 марта 2020 № 722, в редакции, утвержденной Приказом Министерства здравоохранения Украины от 16.06.2020 года № 1411, в случае получения положительного результата тестов на наличие РНК коронавируса SARS-CoV-2, личные данные пациента, указанные в анкете, и результат исследования будут переданы в лабораторный центр МЗ Украины по административно-территориальной принадлежности.

Аналитическая чувствительность

1×10³ копий/мл исходного образца.

Аналитическая специфичность

Перекрестных реакций с вирусами (грипп А и В, парагрипп, аденовирусная инфекция, респираторно-синцитиальная инфекция, метапневмовирусная инфекция, риновирусная инфекция и коронавирусная инфекция человека, вызванная hCov NL63, hCov OC43, hCov 229E, hCov HKUI) и микроорганизмами (Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Streptococcus pyogenes, Staphylococcus aureus) не обнаружено.

Литература

1. Наказ МОЗ України від 28.03.2020 № 722 "Організація надання медичної допомоги хворим на коронавірусну хворобу (COVID-19)".
2. Наказ МОЗ України від 16.06.2020 №1411 «Про внесення змін до Стандартів медичної допомоги «Коронавірусна хвороба (COVID-19)».
3. Яцышина С.Б. Острые респираторные вирусные инфекции. Лабораторная диагностика инфекционных болезней. Справочник. Под ред. В.И. Покровского, М.Г. Твороговой, Г.А. Шипулина. - М.: Изд. «Бином». 2013:647.
4. Novel Coronavirus (2019-nCoV). World Health Organisation. 
5. Current performance of COVID-19 test methods and devices and proposed performance criteria, Working document of Commission services. European Commission, 16 апреля 2020
6. CDC. Interim Clinical Guidance for Management of Patients with Confirmed Coronavirus Disease (COVID-19) (англ.). Coronavirus Disease 2019 (COVID-19). U. S. Centers for Disease Control and Prevention (11 February 2020). 
7. www.oie.int

При оформлении заявок для проведения исследований в ООО «ИНВИТРО» заполняется анкета с обязательным внесением персональных данных.

Анонимно данный тест не оформляется.

Взятие биологического материала рекомендуется проводить до начала приема лекарственных препаратов. 

При подготовке пациента к взятию биоматериала следует учесть:

• за 6 часов до исследования не рекомендуется использовать лекарственные средства для орошения ротоглотки и препараты для рассасывания;
• за 3-4 часа до взятия материала не употреблять пищу, напитки, не курить, не полоскать горло, не чистить зубы.
• непосредственно перед взятием биологического материала не рекомендуется использовать жевательную резинку/пастилки для освежения дыхания;
• если полость носа заполнена слизью, перед процедурой рекомендуется провести высмаркивание.

Важно! 

Взятие материала для исследования на COVID-19 методом ПЦР проводится в определенных Медицинских офисах ИНВИТРО. Прием пациентов в Медицинских офисах ИНВИТРО проводится только при отсутствии симптомов острой респираторной инфекции (повышение температуры тела от 37,5 °C и выше, кашель, одышка, чувство заложенности в грудной клетке, боль в горле, насморк, слабость, головная боль). При наличии указанных признаков необходимо связаться с лечащим врачом и оставаться дома. 

При необходимости, можно воспользоваться услугой «Взятие биоматериала дома». Подробная информация по телефону 0-800-50-90-90.

Пожалуйста, заранее заполните анкету, это ускорит время оформления заказа. Анкету можно заполнить в электронном виде по ссылке или  распечатать в формате pdf и заполнить вручную. При оформлении заявки на тестирование и взятие биоматериала необходимо иметь документ, удостоверяющий личность (паспорт или иной установленный законодательством документ).

Литература

1. Наказ МОЗ України від 28.03.2020 № 722 "Організація надання медичної допомоги хворим на коронавірусну хворобу (COVID-19)".
2. Наказ МОЗ України від 16.06.2020 №1411 «Про внесення змін до Стандартів медичної допомоги «Коронавірусна хвороба (COVID-19)».
3. Яцышина С.Б. Острые респираторные вирусные инфекции. Лабораторная диагностика инфекционных болезней. Справочник. Под ред. В.И. Покровского, М.Г. Твороговой, Г.А. Шипулина. - М.: Изд. «Бином». 2013:647.
4. Novel Coronavirus (2019-nCoV). World Health Organisation. 
5. Current performance of COVID-19 test methods and devices and proposed performance criteria, Working document of Commission services. European Commission, 16 апреля 2020
6. CDC. Interim Clinical Guidance for Management of Patients with Confirmed Coronavirus Disease (COVID-19) (англ.). Coronavirus Disease 2019 (COVID-19). U. S. Centers for Disease Control and Prevention (11 February 2020). 
7. www.oie.int

Наличие клинических проявлений острой респираторной инфекции, бронхита, пневмонии, ОРДС, сепсиса в сочетании с данными эпидемиологического анамнеза:

• посещение за последние 14 дней до появления симптомов эпидемиологически неблагополучных по SARS-CoV-2 стран и регионов;
• наличие тесных контактов за последние 14 дней с лицами, находящимися под наблюдением по инфекции, вызванной новым коронавирусом SARS-CoV-2, которые в последующем заболели или у которых лабораторно подтверждена инфекция SARS-CoV-2.

Литература

1. Наказ МОЗ України від 28.03.2020 № 722 "Організація надання медичної допомоги хворим на коронавірусну хворобу (COVID-19)".
2. Наказ МОЗ України від 16.06.2020 №1411 «Про внесення змін до Стандартів медичної допомоги «Коронавірусна хвороба (COVID-19)».
3. Яцышина С.Б. Острые респираторные вирусные инфекции. Лабораторная диагностика инфекционных болезней. Справочник. Под ред. В.И. Покровского, М.Г. Твороговой, Г.А. Шипулина. - М.: Изд. «Бином». 2013:647.
4. Novel Coronavirus (2019-nCoV). World Health Organisation. 
5. Current performance of COVID-19 test methods and devices and proposed performance criteria, Working document of Commission services. European Commission, 16 апреля 2020
6. CDC. Interim Clinical Guidance for Management of Patients with Confirmed Coronavirus Disease (COVID-19) (англ.). Coronavirus Disease 2019 (COVID-19). U. S. Centers for Disease Control and Prevention (11 February 2020). 
7. www.oie.int

Интерпретация результатов исследования содержит информацию для лечащего врача и не является диагнозом. Информацию из этого раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. Точный диагноз ставит врач, используя как результаты данного обследования, так и нужную информацию из других источников: анамнеза, результатов других обследований и т.д.

Единицы измерения: нет.

Референсные значения: нет.

Интерпретация результатов

Тест качественный. Результат выдается в терминах «обнаружено» или «не обнаружено».

«Обнаружено»: в анализируемом образце биологического материала найдены фрагменты РНК, специфичные для SARS-CoV-2. 

«Не обнаружено»: в анализируемом образце биологического материала не найдено фрагментов РНК, специфичных для SARS-CoV-2, или концентрация возбудителя в образце ниже границы чувствительности метода.

Обратите внимание! Информация о положительных результатах определения РНК SARS-CoV-2 передается в лабораторные центры МЗ Украины по административно-территориальной принадлежности.

Основания: 

• Приказ Министерства здравоохранения Украины от 28 марта 2020 № 722, в редакции, утвержденной Приказом Министерства здравоохранения Украины от 16.06.2020 года № 1411.

Литература

1. Наказ МОЗ України від 28.03.2020 № 722 "Організація надання медичної допомоги хворим на коронавірусну хворобу (COVID-19)".
2. Наказ МОЗ України від 16.06.2020 №1411 «Про внесення змін до Стандартів медичної допомоги «Коронавірусна хвороба (COVID-19)».
3. Яцышина С.Б. Острые респираторные вирусные инфекции. Лабораторная диагностика инфекционных болезней. Справочник. Под ред. В.И. Покровского, М.Г. Твороговой, Г.А. Шипулина. - М.: Изд. «Бином». 2013:647.
4. Novel Coronavirus (2019-nCoV). World Health Organisation. 
5. Current performance of COVID-19 test methods and devices and proposed performance criteria, Working document of Commission services. European Commission, 16 апреля 2020
6. CDC. Interim Clinical Guidance for Management of Patients with Confirmed Coronavirus Disease (COVID-19) (англ.). Coronavirus Disease 2019 (COVID-19). U. S. Centers for Disease Control and Prevention (11 February 2020). 
7. www.oie.int